Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNF212Q495C1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms