Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3ZCU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms