Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM71Q2Q1W2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms