Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA3Q16787 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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