Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF1Q15637 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF1Q15637 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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