Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK1Q15118 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms