Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIN2CQ14957 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN2CQ14957 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN2CQ14957 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms