Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHD4Q14839 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD4Q14839 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
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