Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARF1Q14162 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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