Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2BQ13224 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2BQ13224 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2BQ13224 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
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