Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H3Q13133 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms