Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms