Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRDM2Q13029 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
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