Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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FOXC1Q12948 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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FOXC1Q12948 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FOXC1Q12948 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXC1Q12948 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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FOXC1Q12948 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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