Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 39.4
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SF3A3Q12874 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-15■■■■■ 39.4
SF3A3Q12874 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 510.19□□□□□ -0.784e-15■■■■■ 39.4
SF3A3Q12874 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 BAP1-209ENST00000490804 870 ntTSL 214.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 ACSL3-210ENST00000540115 624 ntTSL 38.75□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 TRIP10-204ENST00000595319 776 ntTSL 520.79■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 TRIP10-205ENST00000596078 1010 ntTSL 512.77□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 311.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 39.3
SF3A3Q12874 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PAN2-209ENST00000548043 4641 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.866e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PAN2-205ENST00000547226 2642 ntTSL 59.24□□□□□ -0.936e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PAN2-217ENST00000551359 4685 ntTSL 58.14□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 ING5-210ENST00000492488 822 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 210.18□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 36.77□□□□□ -1.333e-69■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-69■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.713e-69■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 PLXNB2-210ENST00000479818 1916 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 ACTN1-207ENST00000553290 619 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 39.2
SF3A3Q12874 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 212.58□□□□□ -0.41e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 210.43□□□□□ -0.741e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.81e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 39.47□□□□□ -0.891e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-12■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DBF4-202ENST00000413643 2694 ntTSL 1 (best)22.72■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-204ENST00000356599 1775 ntTSL 521.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SLC27A1-208ENST00000600277 1423 ntTSL 220.77■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SLC27A1-206ENST00000599380 2596 ntTSL 520.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-212ENST00000602075 763 ntTSL 320.2■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-208ENST00000598415 715 ntTSL 220.2■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-205ENST00000398951 2160 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 DEDD2-203ENST00000593804 1586 ntTSL 219.4■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-210ENST00000600559 550 ntTSL 218.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-206ENST00000598090 463 ntTSL 317.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DDX11-212ENST00000538740 750 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 39.1
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SF3A3Q12874 RFFL-211ENST00000584541 563 ntTSL 417.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SCAP-203ENST00000416208 1222 ntTSL 516.42■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-211ENST00000601135 723 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-213ENST00000602201 556 ntTSL 415.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 GGNBP2-215ENST00000617860 3497 ntTSL 215.85■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 MZF1-205ENST00000596039 657 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-202ENST00000593561 546 ntTSL 415.53■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 DEDD2-207ENST00000598200 465 ntTSL 315.07■□□□□ 01e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 WIPI2-214ENST00000496867 745 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 39.1
SF3A3Q12874 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 39.1
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