Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH17Q12864 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH17Q12864 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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