Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPSF1Q10570 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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