Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms