Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CKAP4Q07065 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP4Q07065 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms