Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms