Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms