Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELQ04864 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELQ04864 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELQ04864 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELQ04864 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELQ04864 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELQ04864 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELQ04864 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELQ04864 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms