Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms