Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms