Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX3P78415 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX3P78415 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX3P78415 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX3P78415 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX3P78415 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX3P78415 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX3P78415 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX3P78415 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX3P78415 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX3P78415 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX3P78415 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX3P78415 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX3P78415 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX3P78415 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX3P78415 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX3P78415 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms