Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2P78314 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms