Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM193AP78312 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms