Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4BP68371 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms