Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP2P63027 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP2P63027 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms