Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms