Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UFM1P61960 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFM1P61960 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UFM1P61960 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UFM1P61960 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UFM1P61960 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UFM1P61960 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms