Protein–RNA interactions for Protein: P61925

PKIA, cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIAP61925 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKIAP61925 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKIAP61925 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKIAP61925 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms