Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VBP1P61758 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VBP1P61758 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VBP1P61758 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VBP1P61758 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VBP1P61758 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VBP1P61758 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VBP1P61758 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VBP1P61758 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms