Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms