Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FBXW4P57775 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FBXW4P57775 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms