Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4P55056 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC4P55056 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4P55056 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4P55056 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC4P55056 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4P55056 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms