Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms