Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN1P54253 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms