Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOSBP53539 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOSBP53539 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOSBP53539 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOSBP53539 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOSBP53539 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOSBP53539 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOSBP53539 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOSBP53539 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOSBP53539 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOSBP53539 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOSBP53539 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOSBP53539 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOSBP53539 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOSBP53539 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOSBP53539 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOSBP53539 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOSBP53539 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOSBP53539 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOSBP53539 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOSBP53539 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOSBP53539 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOSBP53539 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOSBP53539 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms