Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXNA3P51805 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXNA3P51805 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms