Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERFP50548 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERFP50548 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERFP50548 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERFP50548 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERFP50548 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERFP50548 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERFP50548 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERFP50548 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERFP50548 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERFP50548 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms