Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN1P49768 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms