Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT5P48643 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT5P48643 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT5P48643 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT5P48643 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT5P48643 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT5P48643 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms