Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL35P42766 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL35P42766 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL35P42766 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL35P42766 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL35P42766 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL35P42766 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms