Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CAP42336 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms