Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5CP41229 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5CP41229 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5CP41229 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms