Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP8P40818 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP8P40818 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP8P40818 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP8P40818 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP8P40818 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP8P40818 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP8P40818 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP8P40818 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP8P40818 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP8P40818 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP8P40818 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms