Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLT4P35916 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLT4P35916 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLT4P35916 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLT4P35916 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLT4P35916 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLT4P35916 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLT4P35916 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FLT4P35916 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLT4P35916 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FLT4P35916 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FLT4P35916 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FLT4P35916 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLT4P35916 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FLT4P35916 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLT4P35916 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLT4P35916 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLT4P35916 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLT4P35916 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLT4P35916 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLT4P35916 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLT4P35916 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLT4P35916 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLT4P35916 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLT4P35916 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLT4P35916 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT4P35916 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT4P35916 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms