Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN2P35609 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms