Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTF4P34130 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTF4P34130 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF4P34130 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF4P34130 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF4P34130 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF4P34130 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF4P34130 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTF4P34130 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTF4P34130 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTF4P34130 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTF4P34130 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTF4P34130 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms